Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms