Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms