Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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