Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms