Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpdP50404 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms