Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SrprbP47758 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SrprbP47758 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SrprbP47758 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SrprbP47758 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SrprbP47758 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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SrprbP47758 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SrprbP47758 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SrprbP47758 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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