Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VhlP40338 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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