Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Flt1P35969 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Flt1P35969 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Flt1P35969 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Flt1P35969 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms