Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Celf1P28659 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Celf1P28659 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms