Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa5P28312 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa5P28312 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa5P28312 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms