Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms