Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms