Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VimP20152 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VimP20152 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VimP20152 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VimP20152 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VimP20152 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VimP20152 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VimP20152 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VimP20152 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
VimP20152 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VimP20152 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VimP20152 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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