Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms