Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms