Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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