Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops6O88545 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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