Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgceO70258 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgceO70258 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgceO70258 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgceO70258 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgceO70258 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgceO70258 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms