Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E2f6O54917 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms