Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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