Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5458L7N219 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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