Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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