Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm21900J3QP38 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm21900J3QP38 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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