Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim18J3QNP2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim18J3QNP2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim18J3QNP2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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