Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc180J3QNE4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc180J3QNE4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc180J3QNE4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc180J3QNE4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc180J3QNE4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms