Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms