Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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