Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6594J3QM43 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms