Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem200cJ3QK46 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms