Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20696H3BJN7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20696H3BJN7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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