Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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