Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms