Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms