Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms