Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms