Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms