Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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BC035044E0CXF8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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BC035044E0CXF8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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BC035044E0CXF8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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BC035044E0CXF8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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BC035044E0CXF8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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BC035044E0CXF8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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BC035044E0CXF8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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BC035044E0CXF8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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BC035044E0CXF8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC035044E0CXF8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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