Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms