Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms