Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms