Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprbB2RU80 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprbB2RU80 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprbB2RU80 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PtprbB2RU80 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PtprbB2RU80 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PtprbB2RU80 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PtprbB2RU80 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms