Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms