Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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