Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skint4A7TZF3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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