Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms