Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms