Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms