Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms