Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms