Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp11cQ9QZW0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp11cQ9QZW0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp11cQ9QZW0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms